La station n'est pas conçue comme une simple structure d'accueil de stagiaires. Elle a également une activité de recherche propre, garantissant une vision claire de son appartenance à l'Université.

Le choix a été fait d'installer, sur le site, des recherches appliquées en biologie végétale, en partenariat avec des collectivités locales ou des sociétés privées. Cette orientation rejoint les premiers objectifs définis par G. BONNIER et ses successeurs, et poursuit une longue tradition de l'étude des végétaux dans leur milieu ou confrontés à différents types de stress.

Pour des questions de mise aux normes de sécurité, les activités dans le bâtiment principal ont dues être très réduites. La collaboration avec le laboratoire de "Physiologie de l'Arbre" a permis à la station de continuer à avoir une activité de recherche et à maintenir un savoir faire sur le site.
Trois thèmes de recherche y ont été développés :

Etude réalisées en partenariat avec le Service des Parcs et Jardins de la ville de PARIS

Ce travail a permis de mettre en évidence une différence de sensibilité aux sels de déneigement, le marronnier rouge étant plus résistant que le marronnier blanc.

Le chlorure de sodium et 4 déglaçants du commerce ont été testés, en faisant varier la dose, la période et la répétition des épandages.

Par ailleurs, il a été montré que les ions toxiques sodium et chlore s'accumulaient dans le tronc et que les produits à base de chlorure de calcium étaient plus toxiques que le chlorure de sodium (contrairement aux idées reçues).Cette étude s'est terminée en 2000.

Etudes financées par la Mairie de PARIS et le Conseil Général de la Seine Saint Denis; étude de faisabilité financée par les Agences de l'Eau

L'intérêt de ces études est d'offrir aux gestionnaires des parcs et jardins, aux arboriculteurs et aux forestiers une méthode de traitements phytosanitaires non polluante pour l'environnement. L'implantation sous écorce intéresse tout particulièrement les responsables des espaces verts urbains, où il est souvent très difficile de traiter les arbres.

En collaboration avec le service des cultures du Muséum National d'Histoire Naturelle, les sociétés SYNKEM et INDENA

Cette espèce d'arbre est exploitée pour son écorce, par l'industrie pharmaceutique. Deux membres de la station (O. LOISON et G. HEBERT) ont participé aux campagnes de récolte des échantillons (Mont Cameroun 2000, Madagascar 2001)

D'autres recherches, ont été également initiées sur le site comme : l'effet de la thermopériode sur le fonctionnement photosynthétique des orchidées tropicales terrestres (travaux de M. G. HEBERT). Des variations d'un ou deux degrés font passer la plante du fonctionnement photosynthétique classique (C3, fonctionnement diurne) à un fonctionnement type "plantes grasses" où le gaz carbonique est capturé la nuit.

Enfin, des expérimentations sont actuellement en cours afin de lutter contre une espèce invasive. Ces tests sont réalisés dans le cadre de la thèse de doctorat de M. MOTARD, co-encadrée par le Laboratoire de Physiologie de l'Arbre (Université Paris7) et le Muséum d'Histoire Naturelle de Paris : "Etude d'une espèce envahissante Ailanthus altissima en biologie de la conservation".

Tous ces travaux font donc une large place à l'expérimentation "au champs", dans des conditions protégées. Ils nécessitent l'utilisation des placettes expérimentales de la pépinière sur lesquelles aucun amendement ni traitement phytosanitaire n'est appliqué. Près de 150 marronniers de 12 ans ont été plantés, pour l'étude sur les sels de déneigement. Ils ont été remplacés par des tilleuls, pour l'étude sur les implants de pesticides. Des arbres plus âgés de la zone boisée sont également utilisés pour ces recherches.